真菌基因组DE NOVO测序
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- CAS号:
- 英文名:
- Fungal genome DE NOVO sequencing
- 英文别名:
- 中文名:
- 真菌基因组DE NOVO测序
- 中文别名:
- 真菌基因组DE NOVO测序
- CBNumber:
- CB85531224
- 分子式:
- 分子量:
- 0
- MOL File:
- Mol file
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真菌基因组DE NOVO测序性质、用途与生产工艺
真菌基因组DE NOVO测序,也叫从头测序,指对真菌进行从头测序。即对未知基因组序列或无近源菌种基因组信息的某个菌种的基因组DNA片段及其文库进行测序,然后用生物信息学方法进行拼接、组装和注释,并对其进行结构和功能研究,尽可能地获得该菌种的基因组序列图谱,从而推动该菌种的后续研究。
![真菌基因组DE NOVO测序](https://www.chemicalbook.com/NewsImg/2020-02-04/20202493447307669.png)
真菌的基因组通常较大且复杂,传统的技术无法满足真菌全基因研究的大数据量需求,目前采用二三代DE NOVO测序联合组装的策略可实现真菌精细图组装,某些项目可组装到接近完成图水平,为真菌的研究提供强有力的支撑,可用于预测真菌的重要基因和蛋白以了解其功能和可能机制;在研究植物致病性真菌方面,真菌基因组DE NOVO测序可以鉴定致病真菌与农作物互作及致病的相关基因,并可用于研究与其近缘物种的进化关系,比较基因组研究等;在食用真菌和药用真菌的研究方面,真菌基因组DE NOVO测序可以用于发现真菌复杂的代谢途径,鉴定其对人有益的代谢产物,及物种进化关系的研究,比较基因组等;另外真菌基因组DE NOVO测序还可用于生物防治真菌的研究,工业酵母菌的研究等。
真菌基因组DE NOVO测序
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