泊利氯铵的优势是相对其他常用抑菌剂而言的，经常拿了和它对比的是苯扎氯铵，在针对铜绿假单胞、大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌、白色念珠菌和黑曲霉五个菌种的抑菌效力检查中，两者的抑菌效力相当，但是泊利氯铵是一种亲水性阳离子聚合物，分子大小约为苯扎氯铵的27倍，其分子量大不能进入哺乳动物细胞，这使其具有毒副作用轻、温和有效的优点。
综上，泊利氯铵作为新型的季铵盐类抑菌剂，具有抑菌作用强、毒副作用轻、使用浓度低的特点，其用作眼用制剂抑菌剂，对角膜没有毒性，不影响角膜上皮细胞的正常生长，是较为理想的眼用制剂抑菌剂。相比其他滴眼剂用抑菌剂，具有抗菌谱广，安全性更好，使用浓度更低的优点。
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