染色质免疫沉淀(ChIP)结合定量PCR可用于研究已知基因组结合位点处的蛋白质- DNA相互作用。如果位点未知,qPCR引物也可以针对潜在的调控区域(例如启动子)进行设计。ChIP - qPCR在关注特定基因和潜在调控区域的研究中具有优势,因为qPCR的成本极低,可以在不同的实验条件下进行。该技术现在用于各种生命科学学科,包括细胞分化,肿瘤抑制基因沉默以及组蛋白修饰对基因表达的影响等。
实验原理
甲醛使DNA与其结合蛋白交联,通过超声波或酶处理,使染色质断裂为小片段,加入特定抗体,对目的基因进行标记,免疫沉淀得到靶片段,解交联得到基因片段,获得的基因片段可用于后续PCR分析。
检测流程
染色质准备→染色质剪切→染色质免疫沉淀→DNA纯化→qPCR
检测方法
技术方法:荧光定量PCR
样本类型:细胞、组织
实验周期:2~3星期
上海启因生物科技有限公司
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