真菌基因组DNA提取试剂盒(目录号:RTG2407)
● 试剂盒内容及保存:
● 储存条件和效期:
室温保存,24个月内有效。Buffer C2于Buffer C3可能有沉淀产生,37℃水浴溶解后即可。RNase A常温运输,-20℃保存。
● 产品简介:
该试剂盒采用简便的硅胶柱结合纯化方式和独特的溶液处理系统,可在60分钟内可处理多个100mg新鲜或30mg干燥真菌组织样品。独特的缓冲液与硅胶柱可以有效的去除组织裂解物种的多糖,酚类,以及酶抑制物。该试剂盒提取到的DNA可以用于PCR,Southern杂交,酶切消化等实验。无需使用酚氯仿等有机,可以同时进行多个样品的处理。
● 准备工作:
1. 准备65℃水浴;无水乙醇;异丙醇;制冰机;1.5ml离心管;2ml离心管
2. 按照标签所示在漂洗缓冲液PW中加入无水乙醇,混匀后盖紧瓶盖后室温贮存备用。
3. 每次使用前请检查缓冲液R2,缓冲液R3是否有沉淀生成,如果出现沉淀,37℃温浴至沉淀溶解后再使用。
● 标准操作步骤:
如非指出,所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
1.样品的处理:
A.新鲜样品:新鲜样品可以用液氮研磨成粉末。或者在45℃烘箱下过夜来干燥后按干燥样品进行操作。
B.干燥样品:用研钵或研磨研杵研磨成粉末。
2. 小于100mg新鲜样品或者小于20mg干燥样品,加入600μl Buffer C1及4μl RNase A涡旋混匀。
3.65℃水浴10分钟。孵育过程中短暂涡旋管子几次。
4. 加入150μl Buffer C2,颠倒振荡混匀,冰上放置1分钟后10,000×g下离心3min。 (离心后应分层,如还有漂浮物,请延长离心时间)。
5. 小心地把上清液吸至另一新的小离心管中。注意确保不要打散沉淀团或把组织碎片也一起转移。
6. 加入二分之一上清体积的 Buffer C3与与等体积的无水乙醇,充分混匀。如:向300μl 上清中加入150μl Buffer C3与300μl无水乙醇。
7. 把上述混匀的液体转移到分离柱上。10,000×g离心1 min以结合DNA,弃去滤出液体。纯化柱容量为750μl,如果混合液大于750μl,请分两次过柱。
8. 将GBC吸附柱重新套回收集管中,加入600μl DNA Wash Buffer(使用前须按要求用无水乙醇稀释)至柱子中,10,000×g离心1min,倒弃流出液;
9.再加入600μl DNA Wash Buffer至柱子中,8,000×g离心1min,弃去流出液;
10. 将吸附柱重新套回2ml收集管中,转速(>13.000xg)离心空结合柱1min以干燥柱子的基质;这一步对下面的洗脱步骤至关重要。
12. 将柱子置于1.5ml灭菌离心管,加入50-150μl65℃预热的T洗脱缓冲液EB至柱子的膜中央。室温静置5min;
13. 室温下,离心(>13000g)1min,以洗脱DNA。保留含DNA的流出液。将DNA储于-20℃。
对低DNA含量的样品按如下操作:
1. 收集研磨成粉末的植物组织,新鲜组织约400mg(干燥组织约200mg),置样品于15ml离心管中。
2. 加入9ml Buffer C1,剧烈地漩涡振荡。
3.65℃水浴30-60min。水浴期间颠倒样品数次。
4. 加入2.5ml Buffer C2,充分混匀,3000×g离心10分钟。转移上清到新的15ml离心管中,加入0.7倍的异丙醇,3000×g离心10分钟。
5. 倒掉上清,加入300μl的灭菌去离子水与5μl RNaseA。65℃水浴溶解DNA。
6. DNA完全溶解后,加入150μl Buffer C3与300μl无水乙醇。
7. 按标准操作步骤的第七步,继续往下操作。
● DNA浓度及纯度检测:
基因组DNA片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。提取的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。可配制0.8-1.0%琼脂糖凝胶,使用λ/HindIII判断基因组的大小,完整的基因组大小应在23kb以上。使用分光光度计检测时, OD260/OD280比值应为1.7–1.9之间,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水洗脱,比值可能偏低,但并不表明DNA纯度不高。
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