作为饲料添加剂，氯化胆碱具有以下生理作用：可预防肝脏、肾脏中的脂肪积累及其组织变性；可促进氨基酸的再组合；可提高氨基酸，尤其是必需的氨基酸蛋氨酸在体内的利用率。在日本，氯化胆碱的98%用作鸡、猪、肉牛及鱼虾等动物饲料添加剂。大部分加工成粉剂，50%粉剂的制法是在混合器中预先加入适当粒度的赋形剂，而后滴加氯化胆碱水溶液，经混合、干燥而得。有些商品粉剂还配合有维生素、矿物质、药物等。氯化胆碱是维生素B属药物，用于肝炎、肝机能退化、早期肝硬化、恶性贫血等症。
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