Cy5 (Cyanine 5) 是一种发远红(far-red)荧光的花青素荧光染料。它的消光系数很高,荧光很亮,并且对pH不敏感,一般可以用633 nm或647 nm的激光束激发然后用 Cy5或APC滤片观察,所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。Cy5荧光落在远红光区,使用Cy5或者其它远红光染料的一个重要优势是在这个长波长光谱范围内样品背景荧光较低,而在这个区域CCD相机/检测器检测灵敏度最高。Cy5可以用来标记蛋白,抗体,多肽,纳米粒等,它最用于是标记核酸分子(DNA和RNA)。
NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯,N-hydroxysuccinimide ester(NHS),succinimidyl ester(SE))是生物标记反应中最常用的活化基团。它活化Cy5分子中的羧基,让它可以和目标生物分子上的胺基(主要伯胺)反应生成稳定的酰胺键,从而把Cy5分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白,抗体,多肽表面的常见官能团(来自于赖胺酸侧链),Cy5-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基,只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和Cy5-NHS反应。
本品为脂溶性cy5,易于溶解在二氯甲烷,DMSO,四氢呋喃,DMF等有机溶剂中。
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