新陈代谢网络是十分复杂的网络,而人体的代谢网络尤为复杂。现在多数信号通路的研究都是集中在代谢网络的一个很小的领域。基因组学、蛋白组学研究虽然已经揭示了部分调节通路,但是和代谢网络直接相关的是代谢产物。从茫茫多的代谢产物中选取研究对象,无疑是大海捞针。非靶向性代谢组学又称为发现代谢组学,主要是将对照组和实验组的代谢组(某一生物体的全部代谢物)进行比对,以找出其代谢物的差异。代谢组学研究通过一定的手段能够帮助研究员从众多代谢产物挑出来,提供一个"航拍"的视角,一目了然地发现差异性代谢产物。然后通过已知的代谢通路逆推找出调节酶和基因,完成疾病发病机制、有效制剂治疗机制等方面的研究。 百泰派克公司推出非靶向代谢组学分析服务技术包裹,基于之前发表的文献建立了多种样品处理的技术平台,您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括样品准处理、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。
1. 代谢谱分析(也称为差异表达分析):在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物; 2. 鉴定:进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构; 3. 解释:解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。
1. GC-MS(气相色谱)是代谢组学研究的经典技术,具有技术成熟稳定、分辨率高等特点,同时,由于具有相对完善的数据库,使得定性也更为准确,缺点则主要表现在样品处理复杂,并且对于不易衍生化的物质定性和定量较困难,影响了该技术在更大范围内的应用。 2. LC-MS(液相色谱)优势主要表现在样品制备和前处理简单、实验重复性好,分辨率高,分离和分析范围广,缺点则主要表现在数据库完善程度不够,定性相对困难。
1. 微生物和细胞样本:迅速钝化代谢活动(淬灭),同时保持细胞不裂解 2. 动物体液(如尿、血、组织、器官、唾液):采样后要迅速预处理,如加入抗凝血剂、防腐剂,并立即冷冻处理(-80℃) 3. 植物样本:采集后迅速冷冻(液氮),然后转入-80℃保存,200mg/例 4. 血清样品:500ul/例(不得低于200ul/例),一定避免反复冻融。(血液收集在离心管中静置30分钟进行凝固。然后离心取上清装载于干净的离心管中,再离心5分钟,8000rpm,取上清分装到冻存管中,每管0.5ml,-80℃冻存寄送。) 5. 尿液样品:1ml/例,原则上可以多取一点(尿液直接分装到离心管中,每管1ml,添加一滴(约10ul)质量体积为1/100(w/v)的叠氮化钠,-80℃冻存寄送)
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