背景及概述[1]
纤维蛋白肽A(人)是在凝血酶作用下,纤维蛋白原α(A)链的精-16和甘-17之间的肽链裂解,释放出由1~16个氨基酸组成的FPA。是反映体内凝血活性及纤维蛋白最终形成血栓的可靠指标。血纤维蛋白肽A(人)为在纤维蛋白原活化过程中,最先由纤维蛋白原α链上水解下的片段。
血纤维蛋白肽A(人)的前体蛋白为Fibrinogen。Fibrinogen中含有一信号肽,由19个氨基酸组成,位于原蛋白的1~19区域。因为含有信号肽的蛋白质一般能够被分泌到胞外,作为细胞因子起作用,所以可以认为Fibrinogen是一个分泌蛋白。原蛋白被分泌到胞外时,信号肽被剪切留在胞内,剩下的位于20~664区域的氨基酸链则被分泌到胞外成为两个成熟蛋白,分别为20~35的血纤维蛋白肽A(人)和35~664的Fibrinogen,alphachain,isoformalpha。血纤维蛋白肽A(人)的氨基酸数目为16个,相对分子质量为1536.5,等电点为3.92;负电荷残基总数(Asp+Glu)为4;正电荷残基总数(Arg+Lys)为1;半衰期为4.4h;不稳定系数为22.11,该蛋白分类为稳定蛋白;脂肪系数为55.00;亲水性评估为-0.431。
相关研究[1]
用TargetP对血纤维蛋白肽A(人)进行亚细胞定位预测,发现并不定位于核内,跨膜区域预测显示不存在跨膜区域,蛋白全部位于膜外。NCBI的UniGene查询结果显示,血纤维蛋白肽A(人)的mRNA在人体不同健康状况下表达丰度依次为肝脏肿瘤、白血病、胃肠肿瘤、肾肿瘤、淋巴瘤、软骨肉瘤、子宫肿瘤、肺癌、生殖细胞瘤,在其他肿瘤中无表达。
应用ClinProt技术系统检测并对比肝癌患者与健康者的血清蛋白表达谱时,发现血纤维蛋白肽A(人)在肝癌患者血清中高表达。近年研究发现,在一些消化道癌症患者血清中发现血纤维蛋白肽A(人)的表达,在肝癌患者的血清中也发现了血纤维蛋白肽A(人)呈高表达。
运用生物信息学对血纤维蛋白肽A(人)进行综合分析,发现血纤维蛋白肽A(人)为亲水蛋白。对血纤维蛋白肽A(人)的亚细胞定位分析,发现其亚细胞定位不在核内,很有可能定位于细胞外。这和作者在肝癌患者血清中发现血纤维蛋白肽A(人)的结果相符。
研究基因和其表达的蛋白在包括肿瘤在内的不同疾病状态下的表达差异已成为深入研究基因结构和蛋白功能的最重要的策略之一。通过NCBI的UniGene查询结果显示,血纤维蛋白肽A(人)在人体多种不同健康状况下均有表达,如胃肠系统肿瘤、软骨肉瘤、子宫肿瘤等,特别在肝脏肿瘤、白血病等中存在显著的表达上调,提示血纤维蛋白肽A(人)可能与人类多种肿瘤的发生、发展密切相关,可作为肝癌等肿瘤标志物。
参考文献
[1]肝癌血清高表达多肽———血纤维蛋白肽A(人)的发现及生物信息学分析