背景[1-3]
植物DNA试剂盒适适用于从植物组织和植物干粉中提取总DNA,包括基因组DNA,线粒体DNA以及叶绿体DNA。本品可以处理多至100 mg的样本,可纯化获得为50 kb的DNA,多数片段在20-30 kb之间。本试剂盒采用先进的硅胶膜技术和简单的离心程序,无需乙醇沉淀,简单快速地分离得到高纯度的DNA,有效去除PCR和其他酶促反应的抑制剂。本品可以在1小时内完成总DNA的提取,纯化得到的DNA可以直接用于酶切、PCR、Real-Time PCR、文库构建、Southern Blot、分子标记等下游实验。
植物DNA试剂盒
操作步骤:
1、取植物新鲜组织约100 mg或干重组织约20 mg,加入液氮充分研磨。
2、将研磨后的粉末收集到离心管(自备)中,加入700μl 65℃预热的Buffer GP1(使用前在预热的Buffer GP1中加入β-巯基乙醇,使其终浓度为0.1%),迅速颠倒混匀后,将离心管置于65℃水浴20分钟,水浴过程中颠倒离心管混匀样品数次。
3、加入700μl氯仿,充分混匀,12000rpm(~~13400×g)离心5分钟。
4、小心将上层水相转入一新的离心管(自备)中,加入700μl Buffer GP2,充分混匀。
5、将步骤4中所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱DM中。若一次不能加完溶液,可分多次转入。12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6、向吸附柱中加入500μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7、向吸附柱中加入500μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤7.
8、12000rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
9、将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-100μlBuffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。
应用[4][5]
用于柿属植物DNA提取纯化检测技术体系的建立研究
柿属(Diospyros spp.)植物为多年生木本植物,其叶片和其他组织中富含大量的多糖、多酚等代谢产物,使提取高质量的DNA比较困难。本课题以柿属植物为材料,对芽、嫩叶、成熟叶、老叶、组培苗、花、萼片、一年生韧皮部、果实及其加工产品柿饼等不同来源的组织器官进行基因组DNA提取,试图建立和完善一套不受时间以及取材部位限制的高质量DNA提取纯化检测技术体系。该技术的建立和优化将为植物种质保存、鉴定和评价奠定坚实的基础,也将为植物品种知识产权保护、基因文库构建、分子辅助育种和基因克隆重组、功能鉴定等的分子生物学下游实验提供技术支持。
主要的研究结果如下:1.用碱裂解法、氯化苄提取法、高盐低pH法、改良SDS法、改良CTAB法及试剂盒法等六种方法对前川次郎组培苗、芽、一年生韧皮部、嫩、叶、花、萼片、幼果、成熟叶、成熟果、老叶、柿饼等不同组织器官进行DNA提取,碱裂解法操作简易省时,但提取效果不佳,其结果的准确性和可靠性较差。另外几种DNA提取方法都在原有方法上作了一定的简化,提取到的DNA质量尚佳,OD260/OD280在1.66-1.78之间,能够用作PCR扩增,说明简化操作流程对DNA质量要求不是太高的PCR反应是可行的。
2.基于CTAB法对鄂柿一号、前川次郎、君迁子等3份材料进行了DNA提取纯化,结果表明:(1)不同时期采样对DNA产率影响很大,随叶片生长,DNA产率不断下降,成熟叶片DNA产率仅为幼嫩叶片的16.7-19.4%;(2)在苯酚氯仿法、高盐乙醚法、CTAB沉淀法等三种纯化方法中以高盐乙醚法效果,可酶切,能有效去除多糖污染,产率较高;(3)四种沉淀方法中,高浓度的盐溶液有助于去除多糖、多酚等杂质,相比单纯的乙醇或异丙醇沉淀获得更高质量的DNA。
参考文献
[1]An efficient protocol for genomic DNA extraction fromCitrus species[J].Yun-Jiang Cheng,Wen-Wu Guo,Hua-Lin Yi,Xiao-Min Pang,Xiuxin Deng.Plant Molecular Biology Reporter.2003(2)
[2]DNA extraction from plants:The use of pectinase[J].Steven Rogstad,Brian Keane,Carolyn Keiffer,Fred Hebard,Paul Sisco.Plant Molecular Biology Reporter.2001(4)
[3]A Rapid DNA Minipreparation Method Suitable for AFLP and Other PCR Applications[J].D.-H.Chen,P.C.Ronald.Plant Molecular Biology Reporter.1999(1)
[4]Comparative Analysis of Different DNA Extraction Protocols:A Fast,Universal Maxi-Preparation of High Quality Plant DNA for Genetic Evaluation and Phylogenetic Studies[J].U.M.Csaikl,H.Bastian,R.Brettschneider,S.Gauch,A.Meir,M.Schauerte,F.Scholz,C.Sperisen,B.Vornam,B.Ziegenhagen.Plant Molecular Biology Reporter.1998(1)
[5]易庆平.柿属植物DNA提取纯化检测技术体系的建立[D].华中农业大学,2006.