鸟苷抑制HCV复制并增加Indel频率,这与胞内核苷酸池的改变有关

2023/5/4 10:21:49 作者:谷雨

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摘要:在研究霉酚酸和利巴韦林抑制丙型肝炎病毒(HCV)感染的机制过程中,作者观察到鸟苷(Gua)对HCV的抑制作用。在本文,研究人员发现四种核苷中,仅GUA抑制HCV在人肝癌细胞中的复制。GUA并不直接抑制NS5B的聚合酶活性,但改变了胞内核苷二磷酸(NDPs)和三磷酸(NTPS)的水平,导致HCV RNA复制不足,减少了传染性子代病毒的产生。NTPs或NDPs浓度的变化改变了NS5B RNA聚合酶的体外活性,影响从头合成RNA和模板切换。此外,GUA介导的这种变化与病毒RNA中INDELs数量的显著增加有关,这可能是病毒后代特异性感染性降低的原因,表明存在有缺陷的病毒基因组。因此,适当的NTP:NDP平衡对于确保HCV聚合酶的保真度和程度减少基因组缺陷的产生至关重要。

全文地址:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1010210

简要内容:

1.核糖核苷对HCV复制的影响

HCV在GUA处理的Huh-7.5细胞上传代,其传染性持续下降(图1A和1B),但在ADE、Cyt或URI存在的情况下,病毒可以持续复制(图1C和1D)。因此,GUA是唯一具有抗病毒活性且无细胞毒性的核苷。由于病毒对细胞的适应性可能影响病毒对抗病毒药物的应答,作者将HCV在Huh-7.5细胞上传代100次,以研究高适合性的HCV对Gua的反应,结果表明,丙型肝炎病毒P100对Gua的耐药性增加。

Fig1.核糖核苷对HCV复制的影响

Fig1.核糖核苷对HCV复制的影响

2.鸟苷对丙型肝炎病毒NS5B活性的影响

为分析GUA抑制HCV复制的机制,作者体外测试了GUA浓度增加对HCV聚合酶活性的影响。当GUA浓度达到500μM时,NS5B聚合酶活性增加,即使在1mM的GUA浓度下,NS5B聚合酶活性也与无GUA处理时相近。只有在非常高的GUA浓度(10 MM)时,RNA聚合酶活性才显着降低(图4A)。使用19-mer寡核苷酸LE19(图4B)也得到了类似的结果。因此,GUA对HCV产生的抑制不能归因于其对RNA聚合酶的直接抑制。      

Fig4. 鸟苷对丙型肝炎病毒NS5B活性的影响

Fig4. 鸟苷对丙型肝炎病毒NS5B活性的影响

3.鸟苷对细胞内核苷酸池的影响

为探讨该抑制作用是否与胞内核糖核苷二磷酸/三磷酸的变化有关,作者测定了ADE、Cyt、GUA或URI作用72h后,HUH-7.5细胞中NTP和NDP的水平,都引起了核苷二磷酸/三磷酸浓度的增加(图5)。然而,只有URI和GUA分别诱导了UTP和GTP的增加,其中GUA引起的变化最为显著(图5A),细胞内NDP浓度如图5B所示。

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Fig5.鸟苷对细胞内核苷酸池的影响

4.核苷二磷酸/三磷酸失衡对体外 HCV NS5B活性的影响

为探索核苷酸浓度的变化是否会影响病毒聚合酶的活性,作者使用重组NS5BΔ21在NTP或NDP浓度增加的情况下的进行了体外RNA聚合实验。在相应的核苷三磷酸浓度增加的情况下,测量了从头合成(DN)、引物延伸(PE)和模板切换(TS)聚合酶的活性(图8)。1 mM的高UTP浓度轻微但显著地降低了引物延伸活性(图8A)。然而,NTP浓度的主要影响RNA的从头合成,其在高ATP浓度下显著下降(图8B),在高GTP浓度下显著增加(图8C)。从头RNA合成的增强伴随着模板切换的增加(图8C)。

由于增加GUA浓度会改变细胞内NDP浓度(图5),作者研究了增加NDP浓度是否影响NS5B RNA聚合酶的体外活性。在固定的核苷三磷酸浓度下,增加相应的核苷二磷酸浓度,并测量了DN、PE、TS的活性(图9)。NDP的主要影响RNA从头合成,其在高浓度的ADP和GDP情况下显著减弱。在引物延伸和模板切换方面则没有统计学差异(图9)。

Fig8. 核苷三磷酸的浓度对NS5B RNA聚合酶活性的影响

Fig8. 核苷三磷酸的浓度对NS5B RNA聚合酶活性的影响

Fig9. NDP对NS5BΔ21 RNA聚合酶活性的影响。

Fig9. NDP对NS5BΔ21 RNA聚合酶活性的影响。

来源:顾俊 CaoLab

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