背景及概述[1]
Escherichiacoli中存在着一类特异识别 8-羟基鸟嘌呤的修复酶:甲酰胺嘧啶 -DNA糖基化酶,这类酶可以将 8-羟基鸟嘌呤从DNA中清除,以保证细胞遗传信息的稳定性,人与Sacharomycescerevisiae同样存在这类修复酶。Fpg (formamidopyrimidine [fapy]-DNA glycosylase,甲酰胺嘧啶 [fapy]-DNA 糖基化酶)也称作 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶、甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(Fpg),既有 N-端糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-端糖基化酶活性可以切下双链 DNA 上受损的嘌呤碱基,产生一个脱嘌呤(AP)位点。AP-裂解酶活性可以切割 AP 位点的 3´ 或 5´ 端,因此可以除去 AP 位点,产生一个具有 3´ 和 5´ 磷酸的碱基缺口。被 Fpg 识别并切除的受损碱基包括:7,8-二羟基-8-氧代鸟嘌呤(8-氧代鸟嘌呤)、8-羟基腺嘌呤、fapy-鸟嘌呤、甲基-fapy-鸟嘌呤、fapy-腺嘌呤、黄曲霉毒素 B1-fapy-鸟嘌呤、5-羟基-胞嘧啶和 5-羟基尿嘧啶。
特性
甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(Fpg)具体有下列特点:
1. 单细胞凝胶电泳 (彗星试验),彗星试验的推荐稀释倍数,1:103~1:104
2. 碱性析出
3. 碱解旋
4. 修饰的切刻平移技术
组分
名称
数量
Fpg (8 U/μl)
100 μl/500 μl
10X Fpg Reaction Buffer
1 ml/1 ml×2
应用
单细胞凝胶电泳;
DNA损伤和修复研究;
SNP分析。
单位定义
1 单位指在 10 μl 反应体系中,37℃条件下, 1 小时内能够切割 1 pmol 含单个与胞嘧啶配对的 8-氧代鸟嘌呤的 34 bp 寡核苷酸双链所需要的酶量定义为一个活性单位。
反应条件
10 mM Bis-Tris(pH 7.0),10 mM MgCl2 ,1mM DTT, 100 μg/ml BSA,37℃ 温育
酶储存液
50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 50 mM KCl, 1 mM DTT, 50% Glycerol.
热失活
60°C 10min。
储存
置于-20°C可保存2年,避免反复冻融。
主要参考文献
[1] 张海涛, 祝其锋. 细胞中特异识别 8—羟基鸟嘌呤的修复酶[D]. , 2001.