背景[1-3]
小蛇菌属通用PCR试剂盒是一种专门用于检测小蛇菌属的体外诊断试剂。它采用了聚合酶链式反应(PCR)技术,能够在短时间内快速、准确地检测出小蛇菌属。
小蛇菌属通用PCR试剂盒的主要成分包括PCR反应液、DNA模板、引物、酶等。其中,PCR反应液是PCR反应的基础,包含PCR反应所需的各种成分,如缓冲液、离子、酶等。DNA模板是含有小蛇菌属特异性基因序列的DNA片段,用于扩增出特异性片段。引物是一段与DNA模板特异性结合的短序列,用于启动PCR反应。酶是热稳定的DNA聚合酶,用于催化DNA合成。
使用小蛇菌属通用PCR试剂盒时,需要将DNA模板、引物和PCR反应液混合后进行PCR反应。在适宜的温度和条件下,引物与DNA模板特异性结合,并通过酶的催化进行DNA合成,最终得到大量的特异性DNA片段。通过凝胶电泳等技术对这些片段进行检测和分析,可以确定是否存在小蛇菌属。
小蛇菌属通用PCR试剂盒
小蛇菌属通用PCR试剂盒具有高灵敏度、高特异性和高可靠性等特点,适用于对感染疾病的诊断,如小蛇菌属感染。同时,它也可以用于研究小蛇菌属的基因组结构和功能,为进一步了解该病原体的生物学特性和流行病学特征提供帮助。
小蛇菌属通用PCR试剂盒是一种重要的实验工具,可以用于快速、准确地检测小蛇菌属。在应用该试剂盒时,需要注意操作规范和质量控制等问题,以保证实验结果的准确性和可靠性。
应用[4-5]
小蛇菌属通用PCR试剂盒可以用于猪粪便中胞内劳森菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌多重PCR方法的建立
建立一种同时检测猪粪便中胞内劳森菌、小蛇菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌的多重PCR检测方法。本研究,摸索了胞内劳森菌的培养方法并且成功地将胞内劳森菌培养到第四代,完成了猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌的复壮,提取了这三种病原足量的基因组用于建立胞内劳森菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌多重PCR检测方法。
本研究在猪粪便中克隆得到完整的胞内劳森菌16S rRNA序列,在分子水平证明了猪场存在胞内劳森菌感染,同时将粪便样本用于验证胞内劳森菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌多重PCR检测方法。
建立胞内劳森菌、小蛇菌属、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌多重PCR检测方法过程为:首先,选择胞内劳森菌天冬氨酸脱氨酶作为胞内劳森菌的目的基因,利用生物信息技术,筛选出猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌基因组中保守并且特异的基因片段作为目的基因。
其次,设计针对目的基因的特异性引物。然后,优化反应体系各种组成成分,调整反应程序,使其达到最佳检测效果。该方法特异性试验显示,只对胞内劳森菌、猪痢疾螺旋体和艰难梭菌产生了特异性条带,该方法的最低检测限度为胞内劳森菌DNA2.6 pg/μL,猪痢疾螺旋体4 pg/μL、艰难梭菌1.2 pg/μL。
本研究工作主要分为三部分:1、胞劳森菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌的培养以及鉴定。
2、本研究首次建立了一种同时检测猪粪便中胞内劳森菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌的多重PCP方法,该方法操作简单、省时、省力,成本低。适用于猪场胞内劳森菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌感染的诊断,为胞内劳森菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌感染的监测和流行病学调查以及进一步研究和防治胞内劳森菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌引起的相关猪的疾病提供了参考方法。
3、从猪粪便样本中克隆到胞内劳森菌16S rRNA序列并进行分析。
参考文献
[1]The emergence of Clostridium difficile PCR ribotype 078 in piglets in the Czech Republic clusters with Clostridium difficile PCR ribotype 078 isolates from Germany,Japan and Taiwan.Marcela Krutova;;Monika Zouharova;;Jana Matejkova;;Jan Tkadlec;;Josef Krej?í;;Martin Faldyna;;Otakar Nyc;;Jan Bernardy.International Journal of Medical Microbiology,2018
[2]PCR-ribotype distribution of Clostridium difficile in Irish pigs.Katharina Stein;;Sarah Egan;;Helen Lynch;;Céline Harmanus;;Lorraine Kyne;;Celine Herra;;Sinead McDermott;;Ed Kuijper;;Fidelma Fitzpatrick;;Susan FitzGerald;;Lynda Fenelon;;Denise Drudy.Anaerobe,2017
[3]A review of methods used for studying the molecular epidemiology of Brachyspira hyodysenteriae.Friederike Zeeh;;Heiko Nathues;;Joachim Frey;;Petra Muellner;;Claes Fellström.Veterinary Microbiology,2017
[4]Rapid detection of Clostridium difficile toxins and laboratory diagnosis of Clostridium difficile infections.Shuyi Chen;;Huawei Gu;;Chunli Sun;;Haiying Wang;;Jufang Wang.Infection,2017
[5]王恒.猪粪便中胞内劳森菌、猪痢疾短螺旋体和艰难梭菌多重PCR方法的建立[D].中国农业科学院,2021.