南非诺卡菌PCR试剂盒的应用

2023/12/28 8:40:42

背景[1-3]

南非诺卡菌PCR试剂盒是一种用于检测南非诺卡菌的PCR试剂盒。该试剂盒利用PCR技术,通过特定的引物和探针,对南非诺卡菌的DNA进行扩增,从而实现对南非诺卡菌的快速、准确检测。

南非诺卡菌是一种常见的真菌,可以引起多种感染,如肺部感染、皮肤感染等。通过使用南非诺卡菌PCR试剂盒,可以快速、准确地检测出南非诺卡菌的存在,为临床诊断和治疗提供有力的支持。

需要注意的是,使用南非诺卡菌PCR试剂盒时,应遵循试剂盒说明书中的操作规范和安全注意事项。同时,对于疑似感染南非诺卡菌的样本,应结合临床表现和其他实验室检查结果进行综合判断。

南非诺卡菌PCR试剂盒通常包括以下组分:

PCR反应缓冲液:用于调节PCR反应体系的pH值和离子强度。

dNTPs:即脱氧核苷酸三磷酸,是PCR反应中必需的原料。

MgCl2:即二氢氧化镁,是PCR反应中必需的离子。

TaqDNA聚合酶:即热稳定DNA聚合酶,可以催化DNA的合成反应。

引物:即特异性DNA序列,可以与目标DNA序列互补结合,引导PCR反应进行。

南非诺卡菌PCR试剂盒.png

南非诺卡菌PCR试剂盒

南非诺卡菌PCR试剂盒的操作步骤如下:

1.样本采集:从患者体内采集血液、粪便、组织等样本,并将其保存在无菌容器中。

2.DNA提取:将采集到的样本进行DNA提取,通常采用柱式或磁珠式DNA提取试剂盒。提取后的DNA应保存在-20°C或更低的温度下。

3.PCR反应体系准备:根据羊痘病毒PCR试剂盒说明书的要求,配制PCR反应体系,包括引物、荧光探针、dNTPs、DNA聚合酶等。

4.PCR反应:将提取的DNA加入到PCR反应体系中,进行PCR反应。反应条件和时间根据试剂盒说明书的要求进行设置。

5.结果分析:将PCR反应后的产物进行荧光信号检测,根据荧光信号的出现情况判断是否存在南非诺卡菌的感染。

应用[4-5]

南非诺卡菌PCR试剂盒可以用于诺卡菌抗酸染色方法的改进和基于rpoB基因的诺卡菌PCR-RFLP分型研究

改进了诺卡菌的抗酸染色方法,并以rpoB作为靶基因,用诺卡菌标准菌种进行PCR-RFLP分型鉴定研究,旨在建立诺卡菌快速鉴定PCR-RFLP操作方案和RFLP标准指纹图谱,为临床快速、准确鉴别诊断提供可靠的参考标准。

材料和方法:1.采用革兰染色方法和抗酸染色方法对标准菌进行染色,同时设计7个浓度梯度的脱色液,进行改良抗酸染色,综合比较三种染色方法的结果。2.使用南非诺卡菌PCR试剂盒分别对7种23株诺卡菌国际参考株的rpoB基因的360bp特异片段进行PCR扩增,PCR产物进行测序和限制性片段长度多态性(RFLP)分析。

结果:1.在显微镜下观察诺卡菌有三种形态,分别为杆状、丝状和球状。用0.125%的硫酸和0.063%的硫酸作为脱色液的改良抗酸染色方法染色阳性率最高,为100%;用4%硫酸脱色的改良抗酸染色方法染色阳性率最低,为30.43%。所用硫酸脱色液浓度为4%、2%、1%、0.5%的改良抗酸染色法进行染色时,阳性对照结果始终为阳性,阴性对照结果均为阴性;使用硫酸脱色液浓度为0.25%、0.125%、0.063%的改良抗酸染色时,阴性对照染色结果为假阳性。

2.应用单一限制性内切酶HaeIII对rpoB基因360bp的南非诺卡菌PCR试剂盒纯化PCR产物进行酶切,得到7种图谱,将7种诺卡菌分成7类,应用单一限制性内切酶MspI对rpoB基因360bp的纯化产物进行酶切得到16种图谱,将7种诺卡菌分成16类。HaeIII和MspI两种限制性内切酶联合应用共得到16种图谱,其中新星诺卡菌和豚鼠诺卡菌具有种特异性图谱,星形诺卡菌有3种图谱,巴西诺卡菌有4种图谱,鼻疽诺卡菌有3种图谱,肉色诺卡菌有2种图谱,南非诺卡菌有2种图谱。

参考文献

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[2]Nocardiosis in Quebec,Canada,1988–2008[J].J.Tremblay;;L.Thibert;;I.Alarie;;L.Valiquette;;J.Pépin.Clinical Microbiology and Infection,2011

[3]Nocardia farcinica lung abscess presenting in the context of advanced HIV infection:Spontaneous resolution in response to highly active antiretroviral therapy alone.[J].King Arienne S;;Castro Jose G;;Dow Gordon Ck.The Canadian journal of infectious diseases&medical microbiology=Journal canadien des maladies infectieuses et de la microbiologie medicale,2009

[4]Molecular diagnosis of fatal Nocardia farcinica pneumonia in an HIV-negative patient.[J].Bocchino Marialuisa;;Paglia Maria Grazia;;Marruchella Almerico;;Contini Silvia;;Festa Anna;;Saltini Cesare.Respiration;international review of thoracic diseases,2008

[5]张媛.诺卡菌抗酸染色方法的改进和基于rpoB基因的诺卡菌PCR-RFLP分型研究[D].南华大学,2013.

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