SM缓冲液的应用

2024/8/29 9:14:42 作者:云霄

背景[1-3]

SM缓冲液,也称为Tris-SM缓冲液或SM液,是一种在科研领域中广泛使用的缓冲溶液。M缓冲液是一种在分子生物学实验中常用的无菌溶液,主要用于稀释和保存λ噬菌体原种。它由硫酸镁、氯化钠、明胶等成分组成,并且经过高压灭菌处理。SM缓冲液的一个重要特点是含有明胶,这有助于在储存过程中稳定λ噬菌体颗粒。

SM缓冲液.png

SM缓冲液

一、组成成分

SM缓冲液主要由以下成分组成:

氯化钠(NaCl):提供必要的离子强度,维持溶液的渗透压。

TRIS(三羟甲基氨基甲烷):作为缓冲剂,调节溶液的pH值,使其保持稳定。

硫酸镁(MgSO4):为溶液提供镁离子,对某些生物过程有重要影响。

明胶:作为稳定剂,有助于保持溶液的稳定性和粘稠度。

二、制备与灭菌

SM缓冲液在制备后,需要经过高压灭菌处理,以确保其无菌状态。这一步骤对于后续的科研实验至关重要,可以避免因微生物污染而导致的实验误差或失败。

三、主要用途

SM缓冲液的主要用途包括:

λ噬菌体原种的保存和稀释:λ噬菌体是最早使用的克隆载体之一,其基因组是长度约为50kb的双链DNA分子。SM缓冲液能够有效地保存和稀释λ噬菌体原种,保持其活性和稳定性。

科研实验:除了用于λ噬菌体的保存和稀释外,SM缓冲液还可能在其他科研实验中发挥重要作用,具体取决于实验的具体需求和设计。

四、使用注意事项

无菌操作:在使用SM缓冲液时,应严格遵守无菌操作规程,以避免微生物污染。

储存条件:SM缓冲液应储存在适当的温度下,通常建议常温储存。但请注意,由于SM缓冲液中含有明胶成分,在低温下可能会形成胶冻状。如果发生这种情况,可以在25-37℃下孵育直至完全溶解后再使用。

实验要求:根据实验的具体要求操作SM缓冲液,确保其发挥最佳效果。

五、价格与市场

SM缓冲液的价格因品牌、规格和销售渠道等因素而异。一般来说,100ml装的SM缓冲液价格在100元左右,而500ml装的价格则可能达到228元左右。具体价格请参考各品牌官网或相关销售平台。

应用[4][5]

SM缓冲液可以用于青枯菌专性噬菌体的筛选及其防控番茄土传青枯病的效果研究

以番茄青枯病(致病菌为Ralstoniasolanacearum,以下简称青枯菌)为研究对象,从我国江苏、浙江、江西和广西4省青枯病发病严重田块的番茄根际土壤中分离出4株青枯菌专性噬菌体,并分别命名为NJ-P3、NB-P21、NC-P34和NN-P42。通过观察4株噬菌体的形态结构、分析鉴定4株噬菌体的基因组信息及其进化渊源以及探讨4株噬菌体的室内生物学特性等,明确了4株噬菌体的分类地位和特性;通过研究噬菌体的最佳保存条件以及在温室和大田条件下防控番茄青枯病的效果,初步建立了青枯菌专性噬菌体应用的技术体系。

具体研究结果如下:1.4株噬菌体在青枯菌平板上均可形成圆形噬菌斑,且噬菌斑清晰透明,直径约为1~2 mm;通过透射电镜观察到4株噬菌体头部均呈正六面体结构,属于尾噬菌体目,短尾噬菌体科。2.基于Illumina Hiseq测序平台,对4株噬菌体进行全基因组测序分析发现,噬菌体NJ-P3、NB-P21、NC-P34和NN-P42基因组长分别为42528 bp、41194bp、41943 bp和42278 bp,G+C含量分别为62.26%、62.22%、61.99%和62.10%。4株噬菌体基因组相似度较高,部分区域出现重排现象,均与短尾青枯菌噬菌体DURPⅡ亲缘关系最近。4株噬菌体分别约有50个蛋白,共享有48个同源蛋白,同源蛋白约占各噬菌体总蛋白的96%,表明4株噬菌体之间具有较高的同源性。3.生物学特性研究发现,4株噬菌体对不同寄主来源的青枯菌均有较强的裂解活性但均不能裂解大肠杆菌和假单胞菌。4株噬菌体滴度均在1.5 X 1011~8.5 X 1011 PFU/mL之间;最佳感染复数均在0.01~0.1之间;感染青枯菌的潜伏时间均为30 min,裂解时间均为90min,NJ-P3的裂解量最小,约为254;4株噬菌体热稳定性均较好,在20~40℃范围内处理24h时,裂解效果最好,但当处理温度高于60℃时,裂解活性均丧失;4株噬菌体在pH为4~10的范围内均有裂解活性,在pH为6~7时裂解活性最高;4株噬菌体均可以耐受紫外线80 min的照射,当照射时间超过90 min时,裂解活性丧失。4.考虑到长途运输的便捷性,对其最佳储存条件进行研究,结果发现4株噬菌体均可以置于常温下保存(25℃),且具有较好的裂解效果。通过对比4株噬菌体在不同溶剂处理下的滴度和侵染活性的变化,可以看出噬菌体NJ-P3和噬菌体NB-P21保存于无菌水中活性最高,噬菌体NC-P34保存于SM缓冲液中活性最高,噬菌体NN-P42保存于30%甘油中活性最高。

参考文献

[1]Parasites and competitors suppress bacterial pathogen synergistically due to evolutionary trade‐offs[J].Xiaofang Wang;;Zhong Wei;;Mei Li;;Xueqi Wang;;Anqi Shan;;Xinlan Mei;;Alexandre Jousset;;Qirong Shen;;Yangchun Xu;;Ville‐Petri Friman.Evolution,2017(3)

[2]Phage–bacteria interaction network in human oral microbiome[J].Jinfeng Wang;;Yuan Gao;;Fangqing Zhao.Environmental Microbiology,2016(7)

[3]Silk route to the acceptance and re‐implementation of bacteriophage therapy[J]..Biotechnology Journal,2016(5)

[4]Genomic diversity of large-plaque-forming podoviruses infecting the phytopathogen Ralstonia solanacearum[J].Takeru Kawasaki;;Erlia Narulita;;Minaho Matsunami;;Hiroki Ishikawa;;Mio Shimizu;;Makoto Fujie;;Anjana Bhunchoth;;Namthip Phironrit;;Orawan Chatchawankanphanich;;Takashi Yamada.Virology,2016

[5]侯玉刚.青枯菌专性噬菌体的筛选及其防控番茄土传青枯病的效果研究[D].南京农业大学,2018.

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