细胞RNA提取
细胞RNA提取 性质
细胞中提取总RNA的方法是用含有异硫氰酸胍和酚的一种单相液来裂解细胞,异硫氰酸狐是一种常见且有效的蛋白质变性剂,在裂解细胞的同时能有效抑制内源性RNA酶活性。同时加入氯仿产生了第二相(有机相),DNA和蛋白质在有机相中被抽提,低pH值的酚将使RNA留在上层水相中。水相中的RNA可用异丙醇沉淀浓缩,随后用乙醇洗涤沉淀,即可去除所有残留的蛋白质和无机盐,最终获得总RNA。(1)样品加入单相裂解液后,室温放置5 min,使样品充分裂解。如不进行下一步操作,样品可放入-70℃长期保存。
(2)如果样品中含有较多蛋白、脂肪、多糖等,12000 rpm离心5 min,取上清。
(3)按每1mL单相裂解液加入200μL氯仿,振荡混匀后室温放置15 min,使其自然分相。禁用旋涡振荡器,以免基因组DNA断裂。
(4)4℃12 000 rpm离心15 min后,样品会分成三层,黄色的有机层,中间层和上层无色的水相,RNA主要在水相中。
(5)小心吸取上层水相,至另一个新的1.5 mL离心管中。不要吸取中间界面,以免DNA和蛋白污染。
(6)在上清中加入等体积冰冷的异丙醇,-20℃放置1h以增加RNA沉淀。
(7)4℃12 000 rpm离心10min,弃上清,RNA沉于管底。
(8)RNA沉淀加入1mL 75%乙醇(用DEPC水配置),温和振荡离心管,悬浮沉淀。
(9)4℃8 000 rpm离心5 min,尽量弃上清。用移液器小心吸弃上清,注意不要吸走RNA沉淀。
(10)室温晾干5〜10 min,让最后残存的痕量乙醇挥发。RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。
(11)用50μL DEPC水或者TE溶解RNA沉淀,RNA溶液要放在-70℃保存。纯水和TE均需DEPC处理并经高压消毒。