RNase R (Ribonuclease R)是由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台表达、纯化获得的一种来源于大肠杆菌的Mg2+依赖的3'→5'核糖核酸外切酶。RNase R能消化线性RNA (Linear RNA),但不能消化环状RNA (Circular RNA, circRNA)、套索RNA (Lariat RNA)、3’突出末端少于7个核苷酸的双链RNA以及具有复杂二级结构的tRNA、5S RNA等[1, 2]。
RNase R常用于消化除去线性RNA,以获得环状RNA (也称环形RNA)、内含子套索(Intron lariat)等非线性RNA。RNase R为环状RNA的研究提供了极大的便利,也可以给研究RNA剪接(RNA splicing)带来很大的便利。套索RNA是在pre-mRNA的剪接内含子过程中产生的,经RNase R消化,可以从总RNA中被分离出来而用于后续研究。
碧云天生产的RNase R不能消化环状RNA但可以消化线性RNA的效果请参考图1。
![](https://img70.chem17.com/9/20230307/638137915541875240347.jpg)
图1. 碧云天生产的R7092 RNase R可以消化线性RNA但不会消化环状RNA的效果图。在20µl反应体系中含20mM Tris-HCl (pH8.0), 0.1mM MgCl2和100mM KCl,以长度为22nt的等摩尔数(4pmol,约0.03μg)的线性或环状RNA作为底物,并加入图中ZHI定量的本产品或国外L公司(Competitor)的RNase R。37℃孵育30min,70℃孵育10min终止反应。随后加入4μl 6X DNA Loading Buffer (D0071),95℃变性5min,然后取出15μl进行7M Urea 15%聚丙烯酰胺凝胶电泳(室温条件下用0.5X TBE作为电泳液,180V电泳90min,NA-Red溶液(1000:1) (D0128/D0130)室温染色10min,拍照观察结果)。如图所示,本产品与国外L公司的产品相比,具有类似的消化效果。图中效果仅供参考,在不同实验条件下获得的效果可能会有所不同,图中效果仅供参考。
用途:环状RNA研究,环状RNA中去除线性RNA,可变剪接研究,内含子套索序列的分析和鉴定等。
来源:由大肠杆菌表达,表达基因为E.coli RNase R基因。
活性定义:One unit converts 1μg of poly-r(A) into acid-soluble nucleotides in 10 minutes at 37℃ in 20mM Tris-HCl (pH8.0), 100mM KCl and 0.1mM MgCl2。
纯度:不含DNase,不含其它RNA内切酶和外切酶活性。
酶储存溶液:50mM Tris-HCl (pH7.5 @25℃), 200mM NaCl, 1mM DTT, 0.1mM EDTA, 50% (v/v) Glycerol, 0.1% (w/v) Triton X-100。
10XReaction Buffer:200mM Tris-HCl (pH8.0 @25℃), 1M KCl, 1mM MgCl2.
失活或抑制:70℃加热10分钟可使RNase R失活。
关键字: Ribonuclease R;RNase R;
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