N-alpha-芴甲氧羰基-N-in-叔丁氧羰基-L-色氨酸在常温常压下为白色至灰白色结晶粉末状,具有一定的吸湿性并且对水较为敏感。其分子中含有羰基保护基团,这些基团可能与水分子发生氢键作用,因此该化合物具有一定的吸湿性。N-alpha-芴甲氧羰基-N-in-叔丁氧羰基-L-色氨酸结构中含有一个保护的吲哚基团和一个活性羧基单元,具有一定的酸性,可发生一系列的针对羧酸单元的化学转化方法。
N-alpha-芴甲氧羰基-N-in-叔丁氧羰基-L-色氨酸是色氨酸类衍生物,可用于制备多种具有生物活性的有机功能分子,在生物化学基础研究中有较为广泛的应用,例如有相关文献报道该物质可用于固相多肽的合成。