概述[1]
在获得一个基因序列后，需要对其进行生物信息学分析，从中尽量发掘信息，从而指导进一步的实验研究。基因序列分析可以通过染色体定位分析、内含子／外显子分析、ORF分析、表达谱分析等，阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等，识别调控区的顺式作用元件，可以为基因的调控研究提供基础。通过蛋白质基本性质分析，疏水性分析，跨膜区预测，信号肽预测，亚细胞定位预测，抗原性位点预测，可以对基因编码蛋白的性质作出初步判断和预测。尤其通过疏水性分析和跨膜区预测可以预测基因是否为膜蛋白，这对确定实验研究方向有重要的参考意义。
应用[2]
通过对H9N2 亚型禽流感病毒分离毒株的HA基因进行了同源性、遗传进化和基因序列分析,为我国H9 N2 亚型禽流感病毒的遗传进化提供了数据,通过继续流感病毒的监测和研究,为该亚型禽流感的防控和疫苗研制提供参考依据.
主要参考文献
[1]陈朗，彭乔烽，刘云红，郑天宇，朱乔峰，刘丽霞。奶牛DQA2基因序列特征分析。图分类号：S823.3 文献标识码：A 文章编号：1004-4264（2019）06-0001-05
[2]杨志远,林健,王小蕾,刘立新,赵际成,潘洁,刘月焕,段会娟。一株H９ N 亚型禽流感病毒的鉴定与HA基因序列分析。动物医学进展,2019 ,４0 (９):13-18