钯碳是化学合成用得较多的贵重催化剂之一，使用过的钯碳催化剂可以再生，如不能再生可以通过一定方法回收金属钯。这样可以将大部分购买钯碳的费用回收回来。
钯碳回收要经过如下过程：焚烧，溶解，精炼。其中最影响回收率的是焚烧步骤。以下的操作可以帮助减少损失：
1.待处理的废钯碳应尽可能不含有机物。废钯碳的焚烧必须做到静态燃烧（没有明火）才能确保钯颗粒不会随着烟雾飞走，碳可以做到静态燃烧，但是有机物燃烧会起明火，烟尘会带走一部分钯。
2.废钯碳中应尽可能不含有硅藻土硅胶等物质。这些硅基物质阻碍了碳的充分燃烧，增加了溶解的难度，还要使用较多酸液进行溶解。这些因素最终都会导致回收成本增加，回收率降低。
3.废钯碳用一定量的水，保持湿润即可，这样可以避免自燃。
大部分钯碳催化的反应，往往在有机溶液中进行，反应完了往往还需要过滤。以下的操作可以帮助有效回收：
1.过滤可以采用滤纸或者滤布，滤纸烧完后残留的灰分很少。滤布可以采用滤布+滤纸+滤布的形式，避免小颗粒透滤，而这些小颗粒中钯含量往往超过钯碳本身的含钯量。
2.如实在要采用硅藻土，可以采用硅藻土+活性炭，或者滤布+硅藻土+滤布的形式。过滤完之后小心把钯碳和硅藻土分别收集。这样可以有效避免废钯碳中掺杂硅藻土。
3.实验室可以放一个装一些水的广口容器，用于收集废钯碳。过滤结束后，可以用少量的水冲洗废钯碳，然后将滤纸把钯碳包起来，一起放到容器里。
4.如果反应体系是甲醇，一定要注意把甲醇过滤掉之后再用水润湿钯碳。干钯碳很容易起火，钯碳+甲醇，甲酸等更容易起火。