毛细线虫通用PCR试剂盒的应用

2023/11/22 8:54:15

背景[1-3]

毛细线虫通用PCR试剂盒是一种用于检测毛细线虫感染的PCR试剂盒。毛细线虫(Trichinella)是一种寄生虫,可引起人类和动物的疾病,如急性胃肠炎、皮疹、肌肉炎等。PCR(聚合酶链反应)是一种高度敏感和特异性的分子生物学技术,可用于检测病原体的DNA或RNA。

PCR(聚合酶链式反应,Polymerase Chain Reaction)是一种分子生物学技术,可以快速、灵敏地检测特定DNA序列的存在。毛细线虫通用PCR试剂盒就是基于这种技术,专门设计用来检测毛细线虫的DNA序列的试剂盒。

毛细线虫通用PCR试剂盒.png

毛细线虫

毛细线虫通用PCR试剂盒通常包含以下成分:

引物:用于扩增毛细线虫特异性基因的一对寡核苷酸序列。

缓冲液:用于维持PCR反应所需的离子浓度和pH值。

dNTPs:为PCR反应提供合成DNA所需的原料。

Taq DNA聚合酶:用于扩增目标DNA片段。

镁离子:为Taq DNA聚合酶提供反应所需的镁离子。

标准品:用于定量检测毛细线虫感染的程度。

使用毛细线虫通用PCR试剂盒进行检测时,首先需要提取样本中的DNA,然后将提取的DNA与引物混合,进行PCR反应。通过检测PCR产物的特异性条带,可以确定是否存在毛细线虫感染。此外,还可以通过标准曲线法对样本中的毛细线虫数量进行定量分析。

毛细线虫通用PCR试剂盒具有高灵敏度、高特异性和快速简便的特点,适用于各种类型的样本,如血液、组织、粪便等。在临床诊断和流行病学调查中具有重要应用价值。

应用[4-5]

毛细线虫通用PCR试剂盒可以用于牛羊仰口线虫PCR-RFLP鉴别方法的建立及线粒体全基因组序列分析

牛仰口线虫(Bunostomum phlebotomum)和羊仰口线虫(Bunostomum trigonocephalum)是寄生于牛、羊小肠内的一类吸血线虫,俗称牛羊钩虫。牛羊感染钩虫会出现贫血、消瘦、生长缓慢、下颌水肿等症状,导致生产性能下降,严重者可引起死亡。

使用毛细线虫通用PCR试剂盒扩增羊仰口线虫和牛仰口线虫线粒体基因组,对整个基因组序列进行完整测序和序列分析,并基于线粒体基因组蛋白质编码基因序列构建系统发生树,阐明羊仰口线虫、牛仰口线虫与其他线虫的进化关系。

本研究采用毛细线虫通用PCR试剂盒PCR方法获得的羊仰口线虫和牛仰口线虫线粒体全基因组序列分别为13771bp和13803bp,均包括12个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和22个tRNA基因,缺乏ATP8基因。羊仰口线虫编码蛋白质基因序列长10290bp,rRNA基因序列长1654bp,非编码区序列长324bp。

整个线粒体基因组核苷酸组成为:A=27.8%,C=6.4%,G=17.0%,T=48.8%,A+T占76.5%,G+C占23.5%。牛仰口线虫蛋白质编码基因序列长10294bp,rRNA基因序列长1655bp,非编码区序列长346bp。整个线粒体基因组核苷酸组成为:A=26.8%,C=6.2%,G=16.9%,T=50.1%,A+T占76.9%,G+C占23.1%。两种虫体基因组碱基组成相似,明显偏好碱基A和T,整个基因组T的含量最高,而C的含量最低,这与其他钩口科线虫线粒体DNA中碱基分布相似。两种线虫的基因排列与圆线目的多数线虫相同,属GA7排列。

以串联的线粒体12个蛋白质编码基因为基因标记,采用MP、BI和NJ法构建系统发生树的结果一致,无尾感器亚纲和有尾感器亚纲为两个大的分支,每个目的虫体各为一独立分支,在目的分支下,同科或同属虫体较近。在钩口科的这个进化类群中,仰口属为一分支,板口属和钩口属为另一分支,牛仰口线虫中国牦牛株与澳大利亚奶牛株关系最近,与十二指肠钩口线虫、犬钩口线虫和美洲板口线虫关系较羊仰口线虫远。这与利用ITS rDNA建树分析研究结果一致,说明线粒体全基因序列是研究寄生虫分子种系发生的良好基因标记。

参考文献

[1]Genetic variation among Clonorchis sinensis isolates from different hosts and geographical locations revealed by sequence analysis of mitochondrial and ribosomal DNA regions.Xiao;;Gao;;Cai;;Dai;;Yang;;Luo;;Agatsuma;;Wang.Mitochondrial DNA,2013

[2]Epidemiology and molecular identification of Anisakis pegreffii(Nematoda:Anisakidae)in the horse mackerel Trachurus trachurus from northern Morocco.N.Abattouy;;A.Valero López;;J.Lozano Maldonado;;M.H.Benajiba;;J.Martín-Sánchez.Journal of Helminthology,2013

[3]Characterization of the complete mitochondrial genomes of two whipworms Trichuris ovis and Trichuris discolor(Nematoda:Trichuridae).Guo-Hua Liu;;Yan Wang;;Min-Jun Xu;;Dong-Hui Zhou;;Yong-Gang Ye;;Jia-Yuan Li;;Hui-Qun Song;;Rui-Qing Lin;;Xing-Quan Zhu.Infection,Genetics and Evolution,2012

[4]Advances in molecular identification,taxonomy,genetic variation and diagnosis of Toxocara spp..Jia Chen;;Dong-Hui Zhou;;Alasdair J.Nisbet;;Min-Jun Xu;;Si-Yang Huang;;Ming-Wei Li;;Chun-Ren Wang;;Xing-Quan Zhu.Infection,Genetics and Evolution,2012

[5]王春仁.牛羊仰口线虫PCR-RFLP鉴别方法的建立及线粒体全基因组序列分析[D].吉林农业大学,2013.

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