背景[1-3]
核酸外切酶1抗体是一类可以特异性结合核酸外切酶1的多克隆抗体，主要用于体外检测核酸外切酶1的免疫学实验。
核酸外切酶I(Exonuclease I,E.coli)具有从3’-5’方向降解单链DNA的外切酶活性,能够逐步释放脱氧核糖核酸5'单磷酸,并留下完整的5'端二核苷酸。该酶来源于携带有E.coli exo I基因的质粒,经重组表达纯化而得。该酶多用于PCR扩增后降解消化引物,该酶对于双链DNA和磷酰或乙酰基团封闭的3’OH末端DNA链无活性。
核酸外切酶1抗体
核酸外切酶（exonucleautomotive service engineers）在核酸水解酶中，是具有从分子链的末端顺次水解磷酸二酯键而生成单核苷酸作用的酶。
核酸外切酶1总对单一核苷酸链作用，在剪切修饰反应中起作用，与核酸内切酶相对应。可大致分为水解磷酸二酯键的3′端生成5′-单核苷酸的酶，及水解5′端生成3′-单核苷酸的酶。前者有蛇毒磷酸二酯酶及大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ等；后者有脾脏磷酸二酯酶、嗜酸乳杆菌（Lac-tobacillus acidophilus）核酸酶。这些酶中还可以区别出从分子链的3′末端或5′末端开始切断和对单链DNA或双链DNA具有特异作用的酶。可利用这些酶水解方式的差异来分析核酸结构。
应用[4][5]
核酸外切酶1抗体用于生物信息学分析核酸外切酶1在肝癌中的异常表达和功能研究
基于基因型-组织表达数据库GTEx、肿瘤基因组图谱TCGA等多种来源的公共数据,分析核酸外切酶1（Exonuclease 1,EXO1）基因在正常人体和多种肿瘤中的表达特征,重点关注其在肝癌中的异常表达、临床和预后意义及其可能作用机制。
方法:利用GTEx网站分析EXO1在正常人体细胞/组织/器官中的表达情况,利用HPA数据库分析EXO1在正常和肿瘤细胞内的定位,利用TCGA门户网站UALCAN、GEPIA、c Bio Portal等分析EXO1在多种肿瘤,特别是肝癌中的表达特征及其异常高表达的可能机制。同时以包含159对肝癌和癌旁正常组织的RNA测序数据作为独立验证数据集。基于TCGA肝癌RNA测序数据获得与EXO1存在高度相关性的共表达基因,通过STRING构建蛋白相互作用网络,并经Funrich软件进行基因本体（Gene ontology,GO）和通路的富集分析。
结果:EXO1主要表达于淋巴细胞中,在少数组织/器官中低水平表达,在包括肝脏在内的多数组织/器官中基本不表达。在正常和肿瘤细胞内EXO1主要定位于细胞核内,包括核浆和核体。而包括肝癌在内的大多数肿瘤组织中显著过表达EXO1。
肝癌中EXO1的高表达与人种、肿瘤分化程度和临床分期相关,并与患者更短的总生存时间和无复发生存时间相关。独立验证结果与TCGA数据分析结果基本一致,肝癌组织中显著高表达的EXO1与患者具有瘤栓、高的血清AFP水平、更晚的BCLC和TNM临床分析,以及更短的总生存时间相关。DNA拷贝数扩增和启动子低甲基化是造成EXO1高表达的可能原因。
对肝癌组织中EXO1的共表达基因分析显示,EXO1可能通过ATM、ATR、Aurora B等信号通路调控细胞周期进展、DNA复制、DNA损伤修复等生物学过程,从而促进肝癌发生发展。结论:EXO1在正常肝脏中基本不表达,而在肝癌组织中显著高表达,并与更恶性的肿瘤生物学行为和不良预后相关。其可能通过调控细胞周期、DNA复制和DNA损伤修复等生物学过程参与细胞癌变。因此可作为潜在的肝癌诊断和预后标志物,以及治疗干预靶点。
参考文献
[1]Exo1 phosphorylation inhibits exonuclease activity and prevents fork collapse in rad53 mutants independently of the 14-3-3 proteins.[J].Morafraile Esther C,Bugallo Alberto,Carreira Raquel,Fernández María,Martín-Castellanos Cristina,Blanco Miguel G,Segurado Mónica.Nucleic acids research.2020(6)
[2]Integrated Proteogenomic Characterization of HBV-Related Hepatocellular Carcinoma[J].Qiang Gao,Hongwen Zhu,Liangqing Dong,Weiwei Shi,Ran Chen,Zhijian Song,Chen Huang,Junqiang Li,Xiaowei Dong,Yanting Zhou,Qian Liu,Lijie Ma,Xiaoying Wang,Jian Zhou,Yansheng Liu,Emily Boja,Ana I.Robles,Weiping Ma,Pei Wang,Yize Li,Li Ding,Bo Wen,Bing Zhang,Henry Rodriguez,Daming Gao,Hu Zhou,Jia Fan.Cell.2019(5)
[3]Comprehensive Analysis Reveals a 4-Gene Signature in Predicting Response to Temozolomide in Low-Grade Glioma Patients[J].Qi Wang,Zongze He,Yong Chen.Cancer Control.2019(1)
[4]Exonuclease 1 expression is associated with clinical progression,metastasis,and survival prognosis of prostate cancer.[J].Luo Fei,Wang Yu-Zhuo,Lin Dong,Li Jian,Yang Kuo.Journal of cellular biochemistry.2019(7)
[5]张慧敏.生物信息学分析核酸外切酶1在肝癌中的异常表达和功能[D].内蒙古医科大学,2020.