1958年，环磷酰胺作为一种广谱抗肿瘤药出现在临床，现今，它仍然是最有效的免疫抑制剂之一。环磷酰胺通过抑制特定的细胞内信号通路，与糖皮质激素联合使用尤为有效。其用于治疗多种自身免疫性疾病包括系统性红斑狼疮、肌炎/皮肌炎、系统性硬化症、白塞病等。
结构与机制
环磷酰胺属于烷化剂类，这类药物会将烷基代入DNA，从而导致细胞死亡。对于绝大多数需要烷化剂治疗的风湿免疫性疾病而言，环磷酰胺是首选。
环磷酰胺主要通过磷酰胺氮芥及其少量其他活性代谢产物发挥DNA烷化作用，导致DNA和DNA蛋白产生交联、DNA断裂，从而减少DNA合成以及细胞凋亡。烷化剂的细胞毒性与DNA发生交联的数目有关，但是细胞毒性和免疫抑制作用之间的关系尚不清楚。
环磷酰胺的作用并非仅限于增生的细胞或特殊类型的细胞，然而不同细胞对它的敏感性各不相同。环磷酰胺的免疫抑制作用包括减少T淋巴细胞和B淋巴细胞数量，抑制淋巴细胞增殖，减少抗体产生，以及抑制新抗原诱发的迟发型超敏反应并保留已建立的迟发型超敏反应。
适应症
对于绝大多数有器官受累的系统性红斑狼疮、系统性坏死性血管炎、进展期系统性硬化症、白塞病合并急性中枢神经系统损害，以及一些合并间质性肺疾病和炎性眼病的相关自身免疫性疾病患者来说，环磷酰胺仍是最常作为其治疗的诱导缓解剂。
对于有严重器官受累的系统性红斑狼疮，如狼疮性肾炎患者，最常用的治疗策略是静脉注射环磷酰胺诱导缓解，然后用硫唑嘌呤或者吗替麦考酚酯维持治疗以最大限度减少环磷酰胺的细胞毒性。环磷酰胺联用静脉滴注甲泼尼龙/口服激素，被认为是诱导肾脏缓解和预防肾脏复发的黄金标准。
用药注意事项
（1）监测血常规和尿常规：第1个月时每周1次，第2~3月时每2周1次，之后每月1次。
（2）孕妇及哺乳期患者禁用环磷酰胺。
（3）在应用环磷酰胺时，应尽量避免接种疫苗。
（4）避免与硫唑嘌呤、环孢素、抗真菌药、抗生素、抗凝药同时合用。
（5）积极预防感染：日常应注意保暖、预防感冒、如有发热，应及时就医加强营养，以提高机体抵抗力。