鼠抗体测序服务

2020/1/15 8:42:37

背景[1-6]

鼠抗体测序服务可为客户提供卓越的抗体测序服务。基于鸟枪法与抗体数据库相结合的技术“Database Assisted Shotgun Sequencing”(DASS)技术,这项技术还适用于其他亚型和不同形式的抗体,如:IGM,荧光偶联抗体,固定化抗体,不同物种的抗体等。DASS技术通过使用最先进的质谱仪和强大的数据处理算法,生成大量序列信息,进而运用最新计算程序对MS/MS光谱从头测序,利用其独特的内部数据挖掘工具保证我们从上万条MS/MS光谱数据中提取目标抗体序列信息。

小鼠是单克隆抗体生产的主要宿主动物,同时也是多克隆抗体生产的宿主。小鼠也是研究普遍使用的模式动物,有成千上万的针对小鼠基因的抗体可供使用。自1975年单克隆抗体技术问世以来为人类疾病的研究起到了重大的推动作用。而大鼠特别适用于对小鼠蛋白质具有限制特异性的IgG型抗体,也是制备IgE抗体的首选动物。仓鼠和豚鼠对小鼠的种系发生距离比大鼠更远,因而可用于制备抗小鼠蛋白质类的抗体

服务类型:

1.等重氨基酸测序:

基于MS测序方法可以分辨大多数等重氨基酸复合物

1.1.W可与GE、AD、SV区分

1.2.R可从GV中区别出来

1.3.Q可从GA、K中区别出来

1.4.N可从GG中区别出来

2.运用DASS技术对V、J、C片段测序

目前已有的一些数据库(如NCBI)虽包含抗体V、J、C片段序列,但是在抗体成熟的过程中,一个B细胞中的抗体基因要经过体细胞突变的过程才会产生高亲和力的成熟抗体。采用独特的计算方法,并能匹配相应物种的突变肽段,保证每条肽段都会被检测到,且每一个氨基酸位点都会生成20-7-条MS/MS光谱,对最难测序的proline和arginine的肽段也可实现测序。

3.CDR3区测序

抗体轻链的CDR3去多由胚系基因编码,而重链的CDR3区则由D基因编码,D基因大部分区域由于受到核酸酶及末端转移酶等重组酶的作用而发生基因重排,导致抗体重链CDR区在数据库中无法进行同源对比,而只能对其进行de novo测序。高质量的质谱数据与高效率的数据挖掘算法的结合,使我们对抗体CDR3区域的解读更为有力,我们可以测得数据库中无同源序列的20kDa的蛋白质。

应用[7]

鼠抗体测序服务可用于人鼠嵌合抗体的基因构建实验中抗体测序服务。

为了克服鼠单克隆抗体在人体治疗中出现的问题,经典的基因工程抗体技术将人源抗体恒定区替代鼠抗体的恒定区,即构建人鼠嵌合抗体。嵌合抗体不仅保留了亲本抗体的特异性和亲和力,大大降低了人抗鼠抗体(HAMA)反应,而且可表现出不同的生物学功能和半衰期。

参考文献

[1]Monoclonal antibodies and im-munoadhesins approved for therapeutic use are on the market.Wu Y,Truong L,Lefranc MP.

[2]Mouse/human chimeric Me1-14antibody:genomic cloning of the variable region genes,linkage to human constant region genes,expression,and characterization.Batra SK,Niswonger ML,Wikstrand CJ,et al.Hybridoma.1994

[3]Human IgG Cγ1domain is cru-cial for the bioactivity of the engineered anti-CD20antibodies.Geng SS,Feng JN,,Yan L,et al.Cel Mo Immunol.2007

[4]Chimeric human antibody molecules:Mouse antigen-binding domains with human constant region domains.Morrison SL,Johnson MJ,Herzenberg LA,et al.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.1984

[5]Specific amplification of rearranged immunoglobulin variable region genes from mouse Hybridoma cells.Gavilondo-cowley J V,Coloma M J,Vazuez J,et al.Hybridoma.1990

[6]Rapid production of full-length cDNAs from rare transcripts:amplification using a single gene-specific oligonucleotide primer.Frohman M A,Dush M K,Martin G R.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of Amercia.1988

[7]胡迪超,张爱华,杨晓明.人鼠嵌合抗体的基因构建[J].中国生物制品学杂志,2009,22(09):933-936

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